2007年中美科技合作执行秘书会议于10月11－12日在上海举行。科技部合作司马林英副司长和美国国务院科技合作办公室Edward Bruce Howard主任作为中美双方执行秘书主持了会议，来自两国政府部门、我驻美使馆、美驻华使馆及上海市科委的近50名代表出席了会议。

会议开幕式上马林英副司长介绍了中国与外国合作设立联合研发机构、共同资助合作项目以及国际科技合作计划的有关情况。Edward Bruce Howard主任介绍了美国与有关国家开展创新合作的案例，并表示美国务院欢迎更多的部门参与到两国科技合作进程中来并将给予积极支持和推动。会议讨论了先进清洁能源技术、核安全合作与和平利用核技术、农业科技、水资源管理、资源节约和综合高效利用、对地观测、减灾防灾、公共卫生和生物医药研究、基础研究、科研人员和科技管理人员的教育、培训和交流、纳米技术和计量标准等议题，两国各对口政府部门的代表回顾了《中美科技合作协定》下签署的部门间协议、议定书、备忘录的执行进展情况，探讨了存在的问题并就未来合作提出了建议。双方还就两国在科技联委会框架下加强创新合作交换了意见。会上两国代表就未来在一系列领域加强合作并启动有关项目达成了广泛的共识。

自1979年1月31日中美两国政府签署《中美科技合作协定》以来，两国的科技合作取得了长足的发展。在该协定的框架下，两国政府有关部门签署了近50个合作议定书（协议、谅解备忘录），合作领域涉及能源、环境、农业、基础科学、科技信息和政策、地学、自然资源、交通、水文和水资源、医药卫生、计量和标准、民用核技术与核安全、统计、自然保护、林业、高能物理、聚变、材料科学和工程计量科学、生物医学、地震、海洋、大气、测绘等众多领域，完成了北京正负电子对撞机、北京谱仪、数字化地震台网、遥感卫星地面站等一批重大项目。中美科技合作已成为两国关系的新亮点，目前已形成“全方位、多层次、宽领域”的特点。两国科技合作与商贸合作、经济合作一起，已成为中美关系的重要组成部分。2006年10月中美科技联委会第12次会议在北京召开，中美双方就多个合作热点问题取得了新的突破并达成了广泛的共识。本次执秘会作为落实联委会后续的重要活动，将对两国有关部门协调和推动政府间科技合作起到积极的作用。