2006年4月4日，“中国可再生能源发展战略研究”咨询项目组召开第二次会议，标志着“可再生能源”项目正式启动。杜祥琬、黄其励、陆佑楣、杨裕生、李泽椿、石元春等院士、国务院发展研究中心谢伏瞻副主任、中国可再生能源学会石定寰理事长、财政部经建司曾晓安副司长等，以及各课题正副组长及主要研究人员共50余人出席会议。
会议由项目组长、中国工程院副院长杜祥琬院士主持，项目副组长黄其励院士介绍了项目立项背景、研究目标、具体内容、研究人员组成以及第一次会议之后各课题组所开展的工作等。李俊峰、贺德馨、邴凤山、石元春、殷志强等课题负责人分别介绍了综合组、风能组、水能组、生物质能组和太阳能组的研究大纲、工作思路和计划，杨裕生院士介绍了可再生能源发展中的储备能技术等。
会议讨论认为，咨询报告主要包括资源、综合技术、产业和政策现状研究；可再生能源发展战略研究；生物质能技术发展路线图与发展战略研究；风能技术发展路线图与发展战略研究；水能技术发展路线图与发展战略研究；太阳能技术发展路线图与发展战略研究；政策咨询研究和建议等内容。
国务院发展研究中心谢伏瞻副主任和财政部经建司曾晓安副司长等分别在作了发言，认为工程院组织对可再生能源发展战略研究十分必要，研究成果要有权威性、综合性和指导性，要加强对可再生能源技术、经济可行性的研究，特别是对液体燃料的研究，要重视对多种可再生能源间的关系，产业、区域布局等方面的研究。
项目副组长黄其励院士对各课题组研究大纲提出了要求，并对以后的工作进行了安排。他建议各课题组参考与借鉴其他课题组的研究提纲以及本次会议的讨论意见，修改完善并形成各组完整的研究提纲和工作进度计划，于5月上旬前提交项目办公室；综合组要加强与其他各组的联系与沟通。他还建议在6月下旬召开该咨询项目的第二次会议，交流各组的工作情况。
项目组长杜祥琬副院长最后做了总结发言。他强调指出，在科学发展观的指导下，大力发展可再生能源是我国能源战略的必然选择。因此，要从观念、政策、技术上为“无油世界”作好准备，推动我国可再生能源的健康发展。
杜祥琬副院长要求，在项目研究过程中，第一，要注重科学性，把研究工作建立在科学的基础之上。要对已有的各种可再生能源的观点进行科学的、客观的评估和分析，对各种可再生能源的投入产出比要进行理性的经济、技术分析，要充分吸取已有的研究成果，采取各种方式听取不同观点专家的意见。太阳能组：还要注重光伏发电，注重掌握源头和上游技术。水电组：为简化问题和便于开展研究，建议以小水电为主要研究对象，对各种影响因素进行综合分析，对能源与环境做出综合评判。风能组：既要研究如何发展的问题（即如何提升制造能力的问题），又要研究如何应用的问题（如上网、储能等），同时还要研究风能的发展空间问题。生物质能组：要注重从产业链的投入产出入手，进行科学的经济、技术分析，同时还要对不同地区进行有针对性的分析。
第二，注重综合性。综合组不仅要集成4个组的研究成果，还要把4个组没有包括进来的、属于可再生能源方面的内容（如海洋能、地热等）以及不同能源的上网问题、不同地区可再生能源的发展等，进行综合分析。另外，综合组还要在综合分析的基础上，结合我国能源结构及其发展趋势，提出我国可再生能源发展阶段、在不同阶段（如2020年、2030年、2050年及以后）战略定位和总的发展战略等。
第三，注重全局性。参加本项目研究的专家来自不同学科、部门、和行业，大家要站在全国的高度，超脱学科专业、部门和行业的局限性，对所研究的内容及其发展战略进行客观、冷静的分析。一要摸清家底，不仅要分析资源量，还要分析可利用的资源量；二要给出发展的路线图，要坚持自主创新和国产化，对于需要国家补贴的项目，要分析需要补贴的力度和时间；三要对各种可再生能源的发展规模进行预测和估计（如2010年、2020年、2050年）；四要提出相应的措施和建议。
最后，会议希望各课题组抓紧时间，开展深入研究。项目组定于6月召开第二次会议，进一步听取各组工作的进展情况，及时讨论发生的新问题。

2006年5月20日