2009年5月份以来，根据近海海域浒苔灾害发展态势，青岛市政府开展了全面的浒苔预防处置工作，学校充分发挥海洋、生命、信息监测等学科优势，认真总结2008年参与处置青岛市近海浒苔灾害的工作经验，积极参与各项预防处置工作。
一、召开校长办公会议专题研究浒苔灾害防控新举措
作为驻青高校和海洋科研单位，学校党委行政高度重视，召开专门校长办公会研究今年的浒苔治理工作，决定要积极响应市委、市政府的号召，一方面，认真总结2008年参与青岛市浒苔灾害治理工作的经验和做法，继续在浒苔发生机制、防治技术和预警预报研究，鲜浒苔的高效打捞设备的研制开发，浒苔综合利用、变害为宝等方面加强深入研究；二是积极投入，认真分析今年浒苔灾害新情况，充分发挥学校科研和人才优势，选派专家，加强科研攻关，为今年的浒苔灾害治理工作再建新功。
二、积极参与《青岛市海洋大型藻类灾害应急处置工作预案》制定工作
5月，青岛市政府拟定了《青岛市海洋大型藻类灾害应急处置工作预案》，应对青岛市近海发生的海洋大型藻类灾害，针对影响或未来可能影响近海海上重大活动、滨海景观、海洋环境等采取应急预警、响应与处置。
在《预案》制定过程中，学校积极参与，副校长翟世奎、董双林专门组织召开学校各相关领域专家学者会议，就《预案》有关内容展开研讨，并认真提出修改意见，很多意见和建议得到了市政府的重视和采纳。
三、作为成员单位并选派专家参与青岛市浒苔灾害处置应急指挥部各项工作
6月5日，青岛市成立了以市委副书记、市长夏耕为总指挥的浒苔灾害处置应急指挥部，下设指挥部办公室、监视监测组、陆域工作组、海域打捞组、新闻宣传组、科研组、军地协调组。
学校作为成员单位参与了监视监测组、陆域工作组、科研组的各项工作，副校长董双林教授作为学校分管领导，全面负责学校参与青岛市浒苔灾害防控工作。学校还选配三位相关领域的专家分别参与到青岛市浒苔灾害处置应急指挥部的各个工作组：
科研组：一方面，学校作为科研组的成员单位，全面参与研究打捞、处理、消杀以及综合利用，并提出对策建议，为全市浒苔灾害处置工作提供科学支撑。另一方面，选派海洋生命学院副院长茅云翔副教授参加本组的日常工作，主要负责浒苔的物种鉴定、生长发育规律、遗传多样性分析等方面的研究。
监视监测组：一方面，学校作为本组的成员单位，参与对浒苔进行监视、监测，分析浒苔的规模、发展趋势，及时发出浒苔灾害预警报等。另一方面，学校选派海洋环境学院物理海洋学博士鲍献文教授参与本组日常工作，主要从事近海环流和海洋动力过程方面的研究，负责通过建立精细化数值模型和数值模拟技术，结合卫星遥感资料，预测浒苔移动路线以及进行动力学分析。
陆域工作组：学校生物工程开发有限公司是本组的成员单位，公司法人代表单俊伟作为专家参与陆域工作组日常工作，主要负责开展浒苔的综合利用方面的研究，包括浒苔粉的加工制备、浒苔多糖的提取，浒苔在海藻肥中的应用等方面的研究。
四、研发《青岛浒苔与相关环境卫星监测服务系统》
在应对和处理浒苔灾害这一突发事件的过程中，适时观测浒苔覆盖情况、时空变化、浒苔来源及信息预报至关重要。日前，学校海洋遥感教育部重点实验室在青岛市科技局的支持下，与美国南佛罗里达大学合作，根据浒苔的光谱特征，提出了一种从卫星图像中快速检测浒苔的新方法――浒苔指数法(简称“FAI”法)。利用FAI方法能较为准确地从卫星图像中检测出浒苔发生的范围、面积、时空变化及其与海表温度、海面风场、海表流场的关系。
在此研究工作基础上，应青岛市的要求，课题组成员夜以继日地工作，在较短的时间内开发出一套面向用户的《青岛浒苔与相关环境卫星监测服务系统》，服务于今年乃至今后浒苔灾害的准实时监测。目前，该系统已在青岛市科技局投入业务化试运行。
在2008年迎战浒苔的关键时刻，学校海洋遥感教育部重点实验室应用卫星遥感高技术手段，及时分析卫星图像资料，密切跟踪浒苔动向，准确提供信息预报，为科学决策提供了服务。
五、开展浒苔无害化处理和综合利用工程
学校生物工程开发有限公司负责浒苔无害化处理和综合利用工作，整体流程为：打捞第一现场压榨脱水打包，初步实现减容、减轻运输量和沿途无海水滴漏等。打包后的浒苔包块集中运输至海大生物胶州处理基地集中烘干处理，形成的浒苔粉打包储藏，用作饲料和肥料的生产。超出胶州基地处理能力的包块，进入缓冲区填埋保存，待浒苔灾害结束后，由生物公司集中处理。
整个浒苔项目占地170亩，用于集中处理缓冲区填埋的浒苔。公司预定压榨脱水打包机14台，预计单台每小时处理鲜浒苔25-30吨；预定大型干燥生产线三条。设备全部投入使用后，每天可处理2000-3000吨鲜浒苔，多余部分进入暂存区。暂存区计划容量3000-5000吨/天。