为了全面贯彻落实省政府的工作部署，在省污染源普查办公室的指导下，省海洋与渔业厅高度重视抓好全省水产养殖业污染源普查工作，各项目标任务如期完成，并取得了阶段性成果。到目前按照《第一次全国污染源普查方案》和农业部的要求，水产养殖业污染源普查工作已进入入户调查和计算机录入阶段。
为切实做好全面普查阶段的工作，省厅环保处于2008年4月2-3日在济南举办了全省水产养殖业污染源普查入户调查及计算机录入培训班。来自全省16个地市及部分县市区的72名普查指导员、录入员参加了本次培训。会上对普查准备阶段的工作进行总结，充分肯定了普查工作已取得的阶段性成果。全省16市均已组织开展了普查指导员和普查员的培训工作，全省共选聘水产养殖业污染源普查指导员和普查员1248人。各市认真组织、搞好动员、加强宣传，及时完成了清查任务。全省16市符合普查要求的水产养殖业污染源普查对象17023个，其中：淡水养殖专业户13150个，淡水养殖场159家，海水养殖专业户3181 个，海水养殖场533家。会议进一步明确了全面普查阶段的目标和任务，安排部署普查表填报、数据审核、录入工作。同时，结合全省工作进展情况，对全面普查阶段的工作提出要求：一是尽快落实经费，搞好保障；二是加强领导，明确责任；三是加强核查，保证普查质量；四是加强普查员监管，确保普查工作顺利进行。会上有关人员还对水产养殖业污染源普查入户调查方法、数据录入软件、数据填报审核方法做了详尽的讲解。通过培训，为完成全面普查阶段的工作任务打下了坚实的基础。
尽管工作取得了阶段性的成果，但从会上交流的情况看，各地在开展工作中仍存在实际困难。大家一致认为经费问题直接关系到普查力量的投入，关系到普查数据的质量，关系到普查工作的成败。大规模的入户调查，对入户调查进行监督和质量控制等方面，都需要充足的经费支持和保障。从目前掌握的情况看，经费落实的难度不容忽视。据了解，经费落实比较好的地市有泰安、烟台、威海。泰安市局普查经费实报实销，其县市区局共争取经费249.5万元；烟台市局争取普查经费109.3万元(落实启动经费20万元),其县市区局争取普查经费292.54万元,启动经费已落实;威海市局普查经费实报实销。另外济南、淄博、德州已经争取到经费但未全部落实；济宁、临沂、潍坊有个别县市区经费已落实。其他市及县市区经费目前仍没有落实，而且个别欠发达县的工作基本没有经费保障。