国家海洋局已在全国重点海域建立了33个赤潮监控区，包括北海（指国家海洋局北海分局管辖范围，下同）11个，东海13个，南海9个。通过这些监控区开展高频率、高密度的监视监测，做到监控区内赤潮发现率百分之百。另外，成立了国家和地方相结合、专业和群众相结合的全国赤潮监视监测网络，在赤潮多发期（每年4月至10月）及频发海域，利用海洋卫星、海监飞机、海监船舶和岸基站等多种手段对赤潮发生情况开展连续监控，及时掌握全海域赤潮发生动态。由海洋行政主管部门统一对外发布赤潮信息，指导沿海的养殖活动，取得明显成效。两年来仅福建和辽宁两省减少赤潮灾害损失2亿元，促进河北、辽宁、天津渔民和政府增收达3亿多元，对当地海洋经济发展和社会稳定产生了积极的影响。