妈祖显灵传说之一：甘泉济师

据记载康熙二十一年十月，清军水师提督施琅奉旨率三万水兵驻扎平海，等待乘风东渡台湾。当时正遇到干旱，军中缺水。平海天后宫旁有一被填废井，施琅命令挖掘，并暗向妈祖祈祷，井挖好后泉水甘口，解了老百姓、兵士用水之难，泉水从此不竭。施琅以为这是神赐甘泉济师，亲书"师泉"二字，此井至今仍存。

妈祖显灵传说之二：佑助收艇

传说康熙二十一年十二月二十六日夜，施琅第一次率兵渡海攻打台澎，因缺风船行很慢，施琅下令回航平海。不久，忽起大风，战舰上小艇被风刮下海，不知去向。第二天风停息后，命令出海寻找小艇，均安然停在湄洲湾中，艇上人报告说：昨夜波浪中见船头有灯光，似人揽艇，是天妃默佑之功。施琅大为感动，命令整修平海天后宫，重塑妈祖神像，捐重金建梳妆楼、朝天阁，并请回妈祖神像一尊奉祀在船上。

妈祖显灵传说之三：澎湖助战

传说康熙二十二年六月，施琅第二次率兵东渡攻打澎湖，军中士兵感到神妃在左右助战，个个英勇向前，千总刘春梦天妃告之二十一日必克澎湖，七月必克台湾。后来清兵强攻澎湖七昼夜，并台湾统一。当时清兵出战攻澎之日，妈祖派千里眼、顺风耳二神将助战，即妈祖"澎湖助战"的神话故事。

妈祖显灵传说之四：托梦建庙

传说宋绍兴二十七年秋（1157年），莆田城东五里处的白湖这个地方，有章氏、邵氏二族人共梦神指地立庙，随后验其地果然是吉地，于是建庙，第二年庙建成。宋绍兴三十年，海寇侵扰，百姓到庙里祈祷，忽然狂风大作，海浪滔天，敌畏惧而退。后来又来侵犯，再次显灵威，很多敌寇被官军擒获。

妈祖显灵传说之五：圣泉救疫

传说宋绍兴二十五年（1155年），兴化一带发生瘟疫，无药可治，妈祖托梦给白湖一村民，说离海边不远的地下有甘泉，喝了可以疗愈疫病。第二天群众前去控掘并取水饮用，果然灵验。消息传开后，远近人都来取水，络绎不绝，染疫的人全都得救了，这口井被誉为"圣泉"。

妈祖显灵传说之六：神女搭救

传说北宋宣和初年，莆田人洪伯通有一次航行在海上，突然遇到飓风，帆船差一点覆没，急忙呼神女搭救，喊声刚刚结束，大海突然风平浪静起来，洪氏躲过了灭顶之灾。

妈祖显灵传说之七：神女救船

传说北宋宣和五年，宋朝派使者率船队出使高丽（今朝鲜），在东海上遇到大风浪，其中八条船沉了七条，只剩下使者所乘的船还在风浪中挣扎，忽然船桅顶上闪现一道红光，一朱衣女神端坐在上面，随即风平浪静，使者所乘的船转危为安。使者惊奇，船上一位莆田人告说是湄洲神女搭救。

妈祖显灵传说之八：保护使节

据记载，郑和七次下西洋中，3次是船队遇到海寇掠夺和受到锡兰山国王亚烈苦奈儿陷害；1次是船队为苏门答刺国生擒；3次是船队在海上遇到飓风和险情。每次都说得到妈祖神灵庇护而脱险。