海洋生态系统的各个领域都有鲨鱼存在。几乎所有的珊瑚礁水域都大量分布着小型底栖性鲨鱼。它们是浅海水域生态系统的重要组成部分。
温带水域分布的有真鲨,虎鲨,猫鲨,三齿鲨,角鲨,偶尔也会有扁鲨出现。这些鲨鱼一般栖息于有珊瑚礁石和具有丰富藻类的沙底海弯和开放性水域。食物一般以丰富的小鱼群和底栖的无脊椎动物为主,例如:蟹、虾、和双壳类。热带珊瑚群中最常见的小型鲨鱼有:斑鳍鲨、猫鲨、护士鲨和须鲨。同样以小鱼和无脊椎动物为食。
大型鲨鱼也会出现在珊瑚礁附近,与小型鲨鱼不同的是它的活动范围远比小型鲨鱼广泛得多。例如温带水域的七鳃鲨,有时出现在水域比较浅的海岸线附近,有时又会出现在较深的大陆架附近。大白鲨则会季节性地出现在海豹和海狮居住的温带近岸水域。其它大型鲨鱼,如大白鲨和许多真鲨类会偶尔出现在与它们栖息的大陆架相邻的海岸线附近。
与其它水域相比较,热带珊瑚礁分布着体型比较大,比较活跃的真鲨类有白翅真鲨,白边真鲨,柠檬鲨,加勒比真鲨。全球热带海域分布最多的鲨鱼要属豹纹鲨,双髻鲨,低鳍真鲨。