2005年，国家海洋局组织开展了我国管辖海域环境质量趋势性监测，陆源入海排污口及邻近海域监测，典型海洋生态脆弱区监测，赤潮监测，以及海水增养殖区、海洋保护区、海水浴场、海洋倾倒区和海上油气开发区等重要海洋功能区监测。

2005年，承担全国海洋环境监测任务的业务机构150余个。动用各类监测船只180余艘，航时16000多小时，总航程15余万海里；海监飞机近300架次，航时600多小时，总航程近20万公里；监测车辆100余辆，行驶总里程200余万公里；共设立各类监测站位8000多个；年累计接收13000余条轨道卫星数据，处理数据量约500GB；获得近160万组海洋环境监测数据。

2005年，国家海洋局在18个近岸海域生态监控区开展生态监测。监控区总面积达5.2万平方公里，主要生态类型包括海湾、河口、滨海湿地、珊瑚礁、红树林和海草床等典型海洋生态系统。监测内容包括环境质量、生物群落结构、产卵场功能以及开发活动等。

2006年3月3日