为了贯彻落实《渔业捕捞许可管理规定》和《关于2003-2010年海洋捕捞渔船控制制度实施意见》，农业部自2009年1月1日起启用了全国海洋渔船动态管理系统开展换发新版海洋渔业捕捞许可证工作。沿海各省（区、市）渔业行政主管部门和各海区渔政局对这项工作高度重视，成立了专门工作班子，指定了换证相关责任人，并按照农业部统一部署，除海南省外，基本完成了捕捞许可管理数据整合导入、新系统启用工作，制订了详细换证实施方案，组织召开了换证人员业务培训，张贴了换证通告，发放了换证宣传资料，新版捕捞许可证换发工作稳步推进。截至2009年6月10日，全国应换证渔船47519艘、1695665千瓦，已换证渔船18553艘、1131943千瓦，换证进度39.04％。其中，天津市、广西区和黄渤海区局换证进度均超过90％，上海市、浙江省和东海区局换证进度近80％，广东、辽宁、山东三省换证进展较慢，换证进度不足15％，海南省未完成渔船数据整合导入，目前尚未开展新证换发工作。