美国总统奥巴马当地时间11月19日晚在在菲律宾首都马尼拉，与日本首相安倍晋三举行了美日首脑会谈。双方确认将在南海问题上加强合作。日本共同社11月19日报道称，关于派遣自卫队赴南海开展“警戒监视”活动的可能性，安倍向奥巴马表示“将关注对日本安全保障影响的同时进行研究”。对于10月达成基本协议的跨太平洋伙伴关系协定(TPP)，双方表示将为早日生效切实展开合作。

两国首脑上次曾于2015年4月在美国华盛顿举行会谈。关于巴黎系列恐怖袭击事件，双方表示为将新的恐怖袭击事件防范于未然，将与国际社会紧密合作。

报道称，会谈中，安倍就南海问题对美国军舰进入中国南海岛礁12海里水域宣示“航行自由”的行动表示支持。奥巴马表示：“将作为日常行动实行下去。”奥巴马还称“关于国际准则、海洋问题和航行自由将推进相关举措”。报道认为，奥巴马此言意在对中国实施牵制。

此外，围绕海洋秩序问题，双方指出遵守国际法的重要性，并一致表示为阻止“单方面改变现状的尝试”将与国际社会进一步推进合作。

安倍就美日同盟强调称：“为对国际社会的和平和稳定作出更大贡献，希望开启新的合作篇章。”奥巴马则谈到日本通过安全保障相关法，并表示肯定称：“能够为在世界上拓展与美国的合作进行磋商。”

关于TPP，两国首脑表示将通过早日生效推进地区内的经济整合，促进经济增长。安倍说：“希望加强日美合作促使早日签署、生效。”

关于美军普天间机场搬迁问题，双方重申将切实推进迁往名护市边野古的计划，安倍表示“这是唯一的解决方案，将以坚定不移的决心予以推进”。

10月27日，美国派军舰擅闯中国南海相关岛礁12海里的行为，已引发中方强烈不满。而作为无关当事国的日本近期在南海问题上跳得很高，正在试图让自己成为“当事国”。该国首相近期在一系列国际会议上多次提及南海问题，并对中国在南海的正常活动表示所谓“关切”，扬言要确保海洋法治。对此，中国外交部发言人洪磊在11月18日的记者会上表示，中方对日方做法表示不满。日本不是南海问题当事国，在南海问题上本应谨言慎行，近期却不断炒作南海问题。日方有关言行不符合当前中日关系改善势头，也不利于地区的稳定和发展。我们敦促日方停止在南海问题上进行无端指责，恪守中日四个政治文件精神，切实落实去年双方达成的四点原则共识，同中方相向而行，以实际行动维护中日关系改善大局。