海洋垃圾可能会对重要的海洋栖息地造成影响。大型的碎片物品，如被遗弃的渔网，可能会使珊瑚窒息，对珊瑚生物体和更大的生态系统都造成破坏。图为一只夏威夷僧海豹在巨大的废弃渔网中。

留在海洋环境中的废弃渔具，能够缠住并杀死具有重要商业价值的海洋生物，如图中的螃蟹。这一过程被称为“鬼钓”(Ghost-Fishing)。

一名潜水员在珍珠和赫尔墨斯环礁营救被渔网缠住的海龟。在2014年的这次任务中，潜水员在该区域解救了3只海龟。

海洋垃圾影响生态系统，废弃渔网困住海龟，窒息珊瑚。