清朝时代，安平大港淤浅，鹿耳门遂成联络台湾、厦门之主要港口。商旅往来皆先至天后宫祭祷以乞舟船平安。康熙五十八年（公元1719年）乃由台湾府文武各官捐奉扩建鹿耳门妈祖庙，始终香火鼎盛，直至曾文溪改道，庙为之毁。
正统鹿耳门圣母庙距昔日郑成功登陆处仅有数百米，近年落成。是目前全世界最大妈祖分祀庙。其建筑使用现代技术，保全中国庙殿特色，雄伟巨大、雕饰华丽，耸立鹿耳门海滨，巍然天后流传。
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正统鹿耳门圣母庙距昔日郑成功登陆处仅有数百米，近年落成。是目前全世界最大妈祖分祀庙。其建筑使用现代技术，保全中国庙殿特色，雄伟巨大、雕饰华丽，耸立鹿耳门海滨，巍然天后流传。
