半滑舌鳎是我国特有的名贵经济海水鱼类，俗称鳎米鱼，属鲽形目、鳎亚目、舌鳎科、舌鳎属。由于其肉质细嫩、味道鲜美、营养丰富，市场价格较高，目前我国半滑舌鳎养殖年产值达15亿元~20亿元。半滑舌鳎的性别决定类型为ZZ/ZW型，雌性具有异型性染色体，雌性个体比雄性个体生长快2倍~4倍，是目前发现的雌雄生长差异最大的鱼类之一。由于雄性个体生长缓慢，影响了渔民养殖的积极性，进而影响了半滑舌鳎养殖产业的发展。因此，采用现代生物技术筛选半滑舌鳎性别相关标记或基因，建立半滑舌鳎遗传性别检测和控制技术，对于促进半滑舌鳎养殖产业的发展至关重要。
近几年来，黄海水产研究所采用分子标记技术相继筛选到半滑舌鳎雌性特异分子标记，建立了遗传性别鉴定的PCR（多聚酶链式反应）技术和分子标记辅助性别控制技术，该技术获得中国水产科学研究院科技进步一等奖和中华农业科技奖一等奖等。在此基础上，为筛选到半滑舌鳎性别特异或性别决定基因、阐明半滑舌鳎性别决定和控制的分子机理，黄海水产研究所陈松林研究员和深圳华大基因研究院王俊博士于2009年12月联合启动了半滑舌鳎全基因组测序和基因图谱绘制研究项目。该项目采用新一代测序技术，依托于深圳华大基因研究院自主研发的一系列序列拼接组装和分析软件，成功进行了半滑舌鳎鱼全基因组测序，绘制了半滑舌鳎基因组图谱。研究发现，半滑舌鳎基因组大小为520Mb（5.2亿个核苷酸），重复序列含量为9.5%，发现的基因大约有2万多个，其中1.8万多个基因与其他物种具有不同程度的同源性，2000多个基因未找到同源基因。
半滑舌鳎基因组测序的完成将为科学家提供大量的重要性状相关功能基因和分子标记，将有利于从功能基因组角度揭示半滑舌鳎生长、发育、繁殖、性别决定及其他重要生命现象的分子机制，为半滑舌鳎性别控制、良种选育、病害防治和健康养殖提供有用的基因资源和技术支撑。
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