发展海洋渔业的总的指导思想是：坚持以改革开放为动力，坚持以高产优质高效为核心，坚持统筹规划、全面发展，坚持依靠科技兴渔，坚持依法治渔。稳定近海捕捞，积极拓展远洋渔业，重点发展增养殖业，搞好水产品深加工，活跃市场流通，使我国海洋渔业逐步向合理化布局、科学化开发、集团化经营、产业化生产和系列化服务的方向发展，使渔业生产的规模、效益、质量走在世界前列，最终实现由传统渔业向现代渔业的战略性转移，促进由海洋渔业大国向现代化海洋经济强国的跨越。
(一)发展目标
由于海洋渔业有着优厚的发展基础和较大的发展潜力，从近期看，其在海洋经济发展中会占据主导地位。但在一定阶段后，其他海洋产业的潜在优势会随着建设“海上中国”构想的实施逐步发挥出来，海洋渔业经济在海洋经济中的比重会呈现出逐步下降趋势。所以，规划海洋渔业发展目标要着眼于整个海洋经济发展趋势，体现出海洋渔业的这一发展规律。笔者规划的海洋渔业发展目标分为三个阶段：2000-2010年，海洋渔业产值占整个海洋经济总产值的55％；2010-2020年占45％；2020-2030年占35％。尽管如此，海洋渔业仍然处于海洋主导产业的位置。届时，海洋第一产业与海洋第二产业、海洋第三业将呈三足鼎立的格局。
基于上述思路和发展目标设想，海洋渔业总产量2010年为2000万吨，其中海洋养殖产量为900万吨，近海捕捞、增殖及外海捕捞产量为900万吨，远洋渔业产量为200万吨；2020年渔业总产量为2450万吨，其中海水养殖产量为l200万吨，近海捕捞、增殖及外海捕捞产量为1000万吨，远洋渔业产量为250万吨；2030年渔业总产量为3000万吨，其中海水养殖产量l500万吨，近海捕捞、增殖及外海捕捞产量为l200万吨，远洋渔业产量为300万吨。
上述指标是以l994年全国海洋水产品总量1240万吨为分析基数，以年净增加产量50万吨为年度目标，这个年度指标明显低于“八五”期间的年增长速度，目的在于适当控制总量的增长，重点提高产品质量。在构想实施阶段：①控制近海捕捞能力的增长，稳步发展外海捕捞。通过扩大增殖和采取保护资源及生态环境等措施来适当增加产量，重点提高捕捞量中的经济鱼虾类比重，争取2010年优质经济鱼虾类占海洋捕捞产量比重达到50％，2020年达到60％，2030年达到70％；增殖放流回捕量占近海捕捞量的比重分别达到：2010年为l0％，2020年为l5％，2030年为20％。②要大力发展海水养殖业，重点发展名、特、优、新、珍、稀品种和大宗出口创汇品种，形成规模效益，争取名优和大宗出口创汇拳头品种占养殖产量比重分别达到：2010年为35％，2020年为45％，2030年为55％。③大力发展远洋渔业，走合作捕捞、合作养殖和公海捕捞相结合的远洋路子，争取到2030年，我国远洋渔业总产量赶上并超过日本。④加大海洋捕捞、增殖和养殖的科技含量，争取科技进步含量在渔业中的比重分别达到：2010年为60％，2020年为70％，2030年为80％。⑤大力发展水产品加工和综合利用。加快发展工副业和服务业，提高产品质量，增加附加值，大力开发出口创汇和海洋保健系列产品。争取海洋水产品工业和服务业的产值占海洋渔业总产值的比重分别达到：2010年为30％，2020年为40％，2030年为50％。形成水产品原值和加工增值各占一半。
(二)基地布局
1．“两岛一湾”综合渔业基地
辽东半岛、山东半岛滩涂贝类、港养鱼虾基地，辽东半岛、山东半岛鱼、虾、贝、藻、海珍品综合增养殖基地；
辽东湾、渤海湾、莱州湾滩涂贝类、港养鱼虾基地，辽东湾、渤海湾、莱州湾海蜇、对虾、梭鱼、魁蚶、毛蚶、梭子蟹和文蛤等增养殖区；
长岛县、长海县海水综合养殖基地，长岛县、长海县鱼、虾、贝、藻增养殖示范区；
大连市、秦皇岛市、烟台市、威海市、青岛市和日照市海珍品出口基地、苗种培育基地、水产品批发市场和水产品精深加工基地； 渤海捕捞区：主要包括辽东湾、滦河口、渤海湾、莱州湾渔场。
2．黄海渔业基地
黄海南部江苏沿海以滩涂贝类、紫菜、对虾、鳗鱼为主的养殖基地，黄海南部海域龟、虾、贝、藻增养殖区；
连云港以苗种培育、水产品批发市场和水产品精深加工为主的综合渔业基地；
黄海捕捞区：主要包括烟威渔场、海洋岛渔场、海东渔场、威东渔场、石岛渔场、石东渔场、青海渔场、连青石渔场、连东渔场、海州湾渔场、吕四渔场、大沙渔场等。
3．东海渔业基地
浙闽沿岸以扩大经济鱼虾的增殖规模为主，重点建设象山港对虾增殖基地和闽东虾鱼贝、闽中鱼虾贝、闽南鱼虾及海珍品增殖区。
建立浦东、宁波、舟山、台湾和温州等综合渔业基地。
东海捕捞区：主要包括长江口渔场、江外渔场、舟山渔场、鱼山渔场、鱼外渔场、温台渔场、温外渔场、闽东渔场、闽外渔场、闽中渔场、台北渔场、闽南渔场、台东渔场等。
4．南海渔业基地
南海重点建设好珍珠湾珍珠贝和海参增殖区，建设大亚湾、大鹏湾、珠江口、钦州湾等一批增殖基地；
海南岛、汕头、广州、湛江重点发展名特优水产品，建立面向港、澳市场的海鲜品综合基地，北海建立以珍珠、对虾、牡蛎和文蛤养殖为主的综合基地，南沙群岛建立外海渔业基地；
南海捕捞区：重点开发粤东近海、粤西近海、北部湾、七洲洋、西沙群岛海域、中沙群岛海域、东沙群岛海域和南沙群岛海域。
5．外海、远洋渔业基地
外海捕捞重点开发沙外渔场、江外渔场、舟外渔场、鱼外渔场、温外渔场、闽外渔场、对马渔场以及南海外海渔场等。
远洋渔业在四大洋建立远洋合作捕捞基地和公海捕捞基地。
