海洋功能区划要达到的目的是：
第一，宏观指导全国的海洋开发活动，建立良好的开发秩序，充分利用海洋资源和空间，发挥其综合效益，形成合理的产业结构和生产力布局。
第二，协调各海洋行业、沿海各地之间在海洋开发利用活动中的关系，为加强和实施海洋综合管理提供科学依据。
第三，为制定全国海洋发展战略、政策和规划创造条件。
第四，为维护国家海洋权益，保护海洋环境，确定海域水质类型，维护良好的海洋生态环境提供依据。