害赤潮的监视监测及研究中，对赤潮的毒性/危害性直接进行评价已显得越来越重要。因为只有了解现场赤潮海水的毒性，才能对赤潮可能带来的危害进行全面的评价和预测，只有了解所发生赤潮的致毒原因及潜在威胁，才能制订出合理的应对措施，保障人类健康，减少经济损失，如对产生赤潮毒素的海域禁止贝类等海产品的收获以防止中毒事件的发生，提早转移或收获可能受影响的海产品，受害水产品的处理和加工利用等等。为此，我们建议在我国的赤潮研究、监视监测中，应将赤潮发生现场的毒性监测结果（生物监测和化学监测）作为重要的数据列入有关的报告中。
对于赤潮的毒性, 人们大多根据现场海洋生物的死亡情况或引发藻种进行判断和报道。由于生物的致死原因是多样的，有可能是毒素致死，有可能是缺氧窒息死亡，还有可能是由于藻细胞上的钩刺损伤，从死亡的现象上来判断致死的原因会存在一定的困难。而且在现场时，对一些较小的现场不易操作的浮游动物的影响容易被忽略掉, 因此仅根据现场观测到的海洋生物的死亡进行危害报道和预测往往是不全面的，也难以体现对人类健康的潜在威胁。
根据藻种组成进行危害/毒性判断也有很大的局限性, 因为这种判断是基于人们以往对藻种毒性的研究基础，但由于人们对藻种的鉴定有时还存在一定的困难，对赤潮藻的毒性类型的了解还很不全面，根据藻种判断毒性就存在了很大的局限性。而且，同种藻不同藻株或同一株藻的不同状态、不同时间下，其毒性都可能有差异。因此，非常有必要对现场赤潮海水取样进行直接的生物和化学方法的毒性评价。