湄洲岛麟山宫位于湄洲岛下山村麟山路185号。麟山宫的具体建立时间无法考证，据说从一辈一辈流传下来，麟山宫是在湄洲祖庙建完之后第三年开始动工的，也就是公元990年建立的。道光二年和乙亥年秋两次重修。麟山宫建设规模较大，占地总面积达3294.9平方米，宫庙的建筑风格比较巧妙独特。1989年9月被莆田县人民政府公布为“第二批重点文物保护单位”。

麟山宫主殿内，左右为在妈祖身边的文武官，接着是十八罗汉，之后靠近妈祖身边的是齐天大圣和张公元帅。左偏殿为王明主尊，是为玉帝的女儿；右偏殿为杨公太师，是为杨五郎；麒麟府位于最右边。

据说，麟山宫在以前是由和尚来管理的，现在主要是由老人接班。老人们在闲暇的时间来看管宫庙。在每年农历三月廿三、四月廿六、九月初九都会举行戏剧活动来庆祝。麟山宫是湄洲岛上唯一一个有两尊妈祖的宫庙。在早期，原先的妈祖（右边）在“文化大革命”中被破坏，之后又重新塑造了一尊。现在每逢节日，出去游灯的是左边的妈祖（新塑造的威望比较高），右边的妈祖就在庙里迎接她的回殿。