1、减少病原微生物和不良藻类、明显增强养殖对象的免疫力和抗病性，降低发病率，提高成活率。用户反映，EM菌可使蟹苗成活率提高近一倍，中华石斑鱼的成活率由原来的30%提高到70%以上。

2、增加有益微生物数量。水面浮游动物、有益藻类增多，特别是红虫不断增多至布满水面。

3、稳定和改善水质，水体颜色清爽，不臭不腐，无硫化氢、氨气等异味，能见度在25－50cm的时间长且较稳定，换水时间可延长2倍以上。