妈祖故居坐落于湄洲湾北岸开发区山亭镇贤良港，背靠祖祠山，面朝妈祖城，为莆田民间传统院落式结构，妈祖林默生前与父母、兄姐即生活在此。宋、元、明三朝，妈祖故居多次修建。清初推行“截界”政策，妈祖故居和莆田“界外”民居一起被焚，复界后一直未重建。
上世纪末，当时秀屿区、乡政府和天后祖祠董事会筹划重建妈祖故居，邀请著名古建筑专家设计。社会各界和台湾妈祖联谊会积极捐助，鼎力支持，妈祖故居于2001年农历闰四月廿五日动工重建，2002年农历九月十五竣工。重建的妈祖故居为仿宋式，分一进（即三间厢），二进（即五间厢）、东西廊、门房、围墙等。

如今，妈祖故居以崭新面貌立于贤良港天后祖祠左侧（如图）。同时还根据史料和传说，建立青年林默塑像，布置复原妈祖生前起居室，包括卧室，织布机房、制药房等，成为妈祖诞生地一大旅游胜迹。