日前，第六届“百种中国杰出学术期刊奖”评选情况揭晓，《海洋与湖沼》连续第六次获得此殊荣，这也是我国水科学研究领域的期刊惟一获该奖项的刊物。

“百种中国杰出学术期刊奖”是由科技部信息研究所根据2006年度中国科技论文与引文数据库（CSTPCD 2006）中期刊被引总频次、影响因子、即年指标、基金论文比、他引总引比等多项评价指标统计结果，经专家评议后选出。

科技部信息研究所同期公布的中国科技期刊引证报告（核心版）显示，《海洋与湖沼》2006年影响因子为1.631，比2005年的1.454又增加了0.177，影响因子居水科学研究领域期刊榜首；在全国6000多种科技期刊中位列第22位（2005年排名为第44位）。