作为中国海洋科学的先驱，在长达76年的科研生涯中，曾呈奎始终坚持与时俱进、自主创新、求真务实，为我国海洋科技界和广大知识分子树立了一座践行“三个代表”重要思想，坚持科学发展观、坚持自主创新的丰碑，成为我国海洋科技界的一面旗帜。

曾呈奎既是“走自主创新之路”的积极倡导者，又是实践者。为推动我国海洋科技的自主创新，他数十年如一日，始终活跃在海洋科学研究的最前沿。

从20世纪30年代开始，他不畏艰难，不辞辛苦，南下海南，北上辽宁，硬是靠着两条腿，完成了对祖国沿海海藻资源的实地调查，采集到数千号海藻标本，逐步摸清了我国海藻资源的“家底”，为中国海藻学研究奠定了坚实基础。他还具体主持和领导了《中国海藻志》的编写，成为世界上最有权威的藻类分类学家之一。

1946年回国后，曾呈奎把全部身心投入到科研上，我国海洋科学事业每一个前进脚步都与他直接相关，一系列重大的奠基性、原创性贡献均与他密不可分。他始终坚持“科研要与经济结合，要为生产服务”的方向，带领科研人员白手起家，研究并创造了一系列具有中国特色的海带、紫菜人工育苗栽培法，领导并推动了藻、贝、虾、鱼海水养殖业“四次浪潮”的形成与发展。特别是由于他对经济海藻的实验生态学研究以及栽培生物学基础进行的创新性研究，我国海藻资源开发利用和化学加工取得了一系列创新性成果，这些先驱性的成就直到今天仍在深刻地影响着中国和世界海洋学界，为中国成为世界海水养殖大国做出了不可磨灭的贡献。他所提出的一整套具有丰富内涵的海洋科学思想，已经得到举世公认。

一系列原创性的成果、奠基性的举动以及高屋建瓴的科学思想，奠定了曾呈奎在世界海洋生物学界无可争议的领军地位。他是一位身体力行的科学家，他更是一位战略科学家。每每在关键时刻，他总是站在科学航船的甲板上，以总揽全局的大科技观和一系列开创性的举措，为中国和世界海洋科学事业领航。他一生先后独立或与人合作发表了400余篇高水平学术论文，出版了12部学术专著，并获得“世界水产养殖学会终身会员”等殊荣，为国家和民族赢得了无上的尊严。