一般按介质、区域、污染源和监测方式的不同分为四类：
按介质可分为海洋水体、生物、沉积物和海面以上大气的监测；
按区域可分为河口、港口和海湾浅水区、陆架上覆水域
的近海区及开阔大洋区的监测；
按污染源则可分为陆源直排口、陆源污染物间接排放口、船舶污染物排放、废弃物海上倾倒、海上油气勘探开发和养殖水域污染监测；
按监测方式可分为定点的常规监测、船舶和海上石油平台溢油、赤潮等应急监测，以及目的明确的专项监测等。