去年莫拉克台风造成垦丁海域珊瑚前所未有的伤害，台大海洋研究所教授戴昌凤调查发现，有四分之三的珊瑚礁健康状态处于受压迫或衰退状态；游憩、渔业等人为活动也是干扰因素。
知名珊瑚生态专家戴昌凤去年受垦丁公园管理处委托，依国际珊瑚总体检标准调查垦丁海域珊瑚。
在十二个地点设置的二十四个测站中，仅六个测站的覆盖率达代表健康状态良好的百分之五十以上；高达四分之三低于五十，代表处于受压迫或衰退；九处甚至在三十十以下。
和三年前调查资料比较，垦丁后壁湖海洋生态保护区内的两个地点和香蕉湾海域，珊瑚覆盖率有上升，但大多数地点均下滑。调查显示八八风灾影响巨大，向风面的万里桐、合界和眺石海域，珊瑚受损尤其严重。
研究团队说，向风面海域的分枝型和叶片型珊瑚受损最严重，团块型不易受损，却仍可见到整株翻倒沙地；伴随大量降雨流入的陆源污染，泥沙沉积物覆盖在礁体上，使珊瑚群体白化、分解或死亡，悬浮物也阻碍光合作用，加上溢出的养殖石斑鱼外来物种，多方面冲击。
此外，在万里桐珊瑚礁区废弃渔网覆盖造成珊瑚死亡情形严重，邻近小区旅馆污水排放和浅水域游憩活动，也可能迫害珊瑚礁。团队建议增设海洋资源保护区，适度管制人为活动，尽速移除半年前搁浅在佳乐水岸边的油轮，以免持续造成破坏。