受台风“纳沙”、“尼格”影响，2011年9月28日后，全省普降大雨，各个市县水产养殖业遭到不同程度损失，省水产研究所积极参与协助灾区水产养殖业恢复生产工作。

台风“纳沙”袭击我省后，给我省特别是临高深水网箱养殖产业带来了严重的损失，9月30日，省水产研究所派遣科技人员第一时间赶赴现场深入了解灾情。10月8日开始，省水产研究所科技人员参加了省海洋与渔业厅灾后恢复生产指导小组东线组和西线组的工作，赴文昌、琼海、万宁、陵水、儋州、昌江、东方等市县协助当地水产养殖业恢复生产。10月10日，省水产研究所科技人员继续前往受灾最为严重的临高县深入开展调研、了解灾情。强台风期该县有1816只深水网箱被台风刮走或击毁，据统计，直接经济损失达6.4亿元，整个产业几近崩溃，目前急需资金政策扶持，补充网箱、恢复生产作业，省水产研究所科研人员先后与临高海洋与渔业局有关负责同志及深水网箱养殖大户进行深入交谈了解，并赴现场查看，积极探索破解之策，和各个深水网箱养殖专业户共同分析强台风造成损失的原因，探讨灾后如何恢复生产工作，为受灾渔业企业继续发展献计献策，同时对提升我省深水网箱养殖安全性能及产业化水平提出了相应的建议。

10月14日省水产研究所科技人员继续参与110培训及灾后恢复生产工作。同时通过各种媒体散发技术资料，指导恢复生产工作。

与此同时，省水产研究所两个科研基地积极开展灾后自救工作，目前基地各项科研活动与生产工作都有条不紊的进行。